アプリはiOS Data Storage Guidelinesに従う必要があり、それらに従えない場合はリジェクトされます
これは技術的な問題ですね。 ガイドラインも変わったりしてるので、チェックしておきましょう。 →https://developer.apple.com/icloud/documentation/data-storage/index.html
AdobeAirで影響がでるようですが、こちらの記事を読んだほうが早い気がします。 →http://cuaoar.jp/2011/11/ios-air.html